Molybdénové terčemajú širokú škálu aplikácií, vrátane, ale nie výlučne:
Výroba polovodičov: Pri výrobe polovodičov a plochých panelových displejov sa molybdénové terče používajú na vytváranie tenkých vrstiev pomocou technológie naprašovania alebo odparovania, ktoré sú nevyhnutnou súčasťou elektronických zariadení.
Technológia povlaku: Molybdénové terče môžu byť použité v rôznych aplikáciách povlakov, ktoré poskytujú vynikajúci výkon a odolnosť.
Radiačná medicína: V radiačnej medicíne majú molybdénové ciele tiež dôležité aplikácie.